นายมานิต มานะทัต เริ่มรับราขการกระทรวงยุติธรรมระหว่างศึกษาอยู่ที่ มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ ในตำแหน่ง เสมียนศาลฎีกา รองจ่าศาลอาญา และ จ่าศาลจังหวัดร้อยเอ็ด จนกระทั่งในปี 2483 ได้รับการแต่งตั้งเป็นผู้พิพากษาประจำกระทรวงยุติธรรม และได้ไปประจำการที่ จังหวัดกาฬสินธุ์ นครราชศรีมา ในปี 2506 ได้รับแต่งตั้งไปประจำการ ณ จังหวัดสุราษฎร์ธานีในตำแหน่งผู้พิพากษาหัวหน้าศาลจังหวัดสุราษฎร์ธานี และในปี 2507 นายมานิต ได้รับพระราขทานโปรดเกล้าเป็น ผู้ข่วยผู้พิพากษาศาลอุทธรณ์ และ อธิบดีผู้พิพากษาศาลอุทธรณ์ตามลำดับ